重庆医科大学信息管理系成立于2007年,与图书馆实行两块牌子、一套班子的管理模式。设置四年制信息管理与信息系统(医药卫生方向)本科专业,2002年开始面向全国招生,在西南地区最早开办该专业。除本科专业外,同时招收“社会医学与卫生事业管理”硕士研究生,研究方向为卫生信息分析、卫生信息化建设等。近年来,注重加强教学基本建设,积极开展教学和人才培养模式改革,人才培养质量得到不断提高,毕业生就业率高。信息管理系建设有信息分析、信息检索、信息技术、病案信息学、医院信息系统等多个跨学科、跨院系教学团队,拥有专兼职教师队伍70多人,师资力量雄厚。承担多项省部级及以上研究项目,多次获得市级和校级教学、科研成果奖,主编或参编多部教育部、卫生部规划教材。信息管理系构建了独具特色的面向卫生信息化的“模块平台式”人才培养体系,依托学校医学、药学、公共卫生、管理学等优势学科,加强拓展与相关专业的交叉融合,加强专业建设,培养卫生信息化高级应用型、创新型人才。2010年成为重庆市高等学校人才培养模式创新实验区。专业课程设置以需求为导向,强化计算机和情报学知识,兼顾医学课程,突出医学信息分析特色。专业实习基地二十多个,涵盖医院、卫生行政部门、医院信息化企业多种类型。