福建医科大学口腔医学系成立于1984年,1998年经国务院学位委员会批准为口腔临床医学硕士学位授权单位,2000年改系建院。2003年,经国务院学位委员会批准为口腔医学硕士专业学位研究生培养单位;2006年,经国务院学位委员会批准为口腔临床医学博士学位授权单位。2011年,经国务院学位委员会批准为口腔医学一级学科硕士点授权单位。学院已形成从学士、硕士到博士的完整学位教育体系。学院建设有一支高素质的师资队伍。教师队伍中,获国务院政府特殊津贴3人,入选福建省百千万人才工程4人,博士生导师3人,硕士生导师19人,福建医科大学学科带头人6人,青年骨干教师11人,多名专家在全国高校口腔医学专业教学指导委员会、中华口腔医学会的各学科专业委员会担任副主任委员、常委或委员。学院设有口腔基础医学、牙体牙髓病学、牙周病学、口腔黏膜病学、儿童口腔医学、预防口腔医学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学9个教研室,福建省口腔医学实验教学中心和福建省高校口腔医学重点实验室,16个临床实习基地,包括一所附属口腔医院。口腔临床医学是福建省省级重点学科;口腔医学专业为福建省省级特色专业;《口腔修复学》、《牙周病学》、《预防口腔医学》、《口腔颌面外科学》4门课程为省级精品课程;口腔医学实验教学中心为省级实验教学示范中心;另有校级精品课程2门、校级教学团队5支。学院获福建省科学技术奖二等奖、三等奖、省级教学成果奖二等奖等奖项。学院每年招收本科生100多人(含港澳台生10余人)、博、硕士研究生40多人。每年平均有30.5%的本科毕业生考取全国重点口腔医学院校和本校研究生。毕业生参加全国口腔执业医师资格考试通过率为95%以上,在全国高等口腔医学院校中名列前茅。学院注重对外交流与合作,与国内外口腔医学学术界保持密切联系,聘请多名国内外口腔医学界知名专家、教授为兼职或客座教授,注重口腔医学最新研究成果的学习运用,不断提升学院教学和学术研究水平,逐步跻身国内同类口腔医学院校的先进行列。

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